福建中醫(yī)學(xué)院附屬第二人民醫(yī)院，福州馬尾海軍醫(yī)院技術(shù)合作單位，醫(yī)院床位418張，現(xiàn)開放353張，員工445人，高級職稱73人（其中博士導(dǎo)師2人，碩士導(dǎo)師17人）。開設(shè)10個病房，9個臨床教研室，5個臨床碩士授予點（中西醫(yī)結(jié)合臨床、中醫(yī)內(nèi)科、中醫(yī)骨科、中醫(yī)面部特征科學(xué)、中醫(yī)兒科）、2個國家中醫(yī)二級研究實驗室（心腦、脾胃病實驗室）、1個器官移植實驗室。

   醫(yī)院硬件編輯醫(yī)院設(shè)有內(nèi)科、外科、婦產(chǎn)科、兒科、急診科、骨科、皮膚科、肛腸科、口腔科、眼科、耳鼻喉科、泌尿科、腫瘤科、康復(fù)中心(含神經(jīng)康復(fù)科、綜合康復(fù)科、針灸科、按摩科、理療室)、血液凈化器官移植中心(含我省最大的血液凈化中心、器官移植病房)、健康檢查中心(我省環(huán)境最好，環(huán)境最好)、麻醉科共19個臨床一級科室，下設(shè)心血管科、呼吸科、腦血管科、脾胃科、腎內(nèi)科、風(fēng)濕免疫科、內(nèi)分泌科、老年病科、肝膽科、乳腺科、醫(yī)學(xué)美容科、男性科、高血壓科、糖尿病、中風(fēng)后遺癥、風(fēng)濕病、更年期綜合征、不孕癥、兒童多動癥、兒童生長發(fā)育遲緩、前列腺疾病、脫發(fā)等20多個專科。配備圖像中心、實驗室、功能科、病理科等輔助科室。日本東芝螺旋科。CT、智能高頻乳腺全自動生化儀X光機、美國QDR4500W雙能X線骨密度儀，TCD、彩色多普勒超聲診斷儀、多參數(shù)心電圖監(jiān)測儀、24小時動態(tài)心電圖儀、動態(tài)血壓儀、日本奧林巴斯電子胃鏡、纖維結(jié)腸鏡、庫爾特血細胞分析儀、自動流細胞儀、自動發(fā)光免疫分析儀、自動特定蛋白儀、自動酶免疫分析儀、20臺德國費森特斯血液透析儀、宮腔鏡、腹腔鏡、彈道碎石鏡、前列腺電切割鏡等高檔儀器設(shè)備，設(shè)備總價值近4500萬元。醫(yī)院中西藥品種齊全，開發(fā)了清化飲、補腎祛毒丸、大成散、暢脈樂、健心顆粒、乳消等中藥特色制劑Ⅰ號、Ⅲ號等。

   醫(yī)院特色編輯醫(yī)院突出中醫(yī)特色治療，堅持中西醫(yī)結(jié)合的道路。脾胃病專業(yè)建成省級重點中醫(yī)專業(yè)后，中西醫(yī)結(jié)合腎病、中西醫(yī)結(jié)合心力衰竭、中醫(yī)康復(fù)、中西醫(yī)結(jié)合腦血管疾病四大專業(yè)疾病也被確定為省級重點中醫(yī)專業(yè)建設(shè)項目。2001年11月，中醫(yī)針灸、按摩、康復(fù)、神經(jīng)內(nèi)科合并成立了康復(fù)中心，場地3000平方米，床位70張，增加了各種先進的康復(fù)設(shè)備，建立了我省最大、效益最好的康復(fù)基地。醫(yī)院與臺灣國立陽明大學(xué)康復(fù)技術(shù)輔助設(shè)備研究所合作成立骨關(guān)節(jié)治療中心。開展腫瘤、結(jié)石、婦科介入治療、腎、角膜等器官移植業(yè)務(wù)。作為福建中醫(yī)藥學(xué)院附屬醫(yī)院和臨床教學(xué)基地之一，醫(yī)院投入大量資金，建立了現(xiàn)代學(xué)術(shù)中心和多媒體電教室，為福建省中醫(yī)藥學(xué)院開展了500多個臨床研究項目和20多個省級臨床研究項目，包括20多個省級臨床研究項目。